تأسس المعهد الدانمركي بدمشق في 12/أيلول 1995 وعمل لفترة تجريبية مدتها خمس سنوات بموافقة مبدئية من وزير التعليم الدانمركي السيد " اولا فيغ ينسن " .

مسودة عمل المعهد تم اعدادها من قبل لجنة تحت رئاسة وزارة التعليم وبالتعاون مع السيد " بيتر مورتنسن " مدير متحف "موسغارد"- وأول مدير للمعهد الدانمركي- والسيد "موغينس بيرد" المسؤل في وزارة التعليم كسكرتير. وقبل ذلك كان قد تم اختيار دمشق كمكان مؤهل ومناسب لتكون مقرا للمعهد .

لقد حددت أهداف المعهد كما يلي :

تعزيز البحث والتعليم والتبادل الثقافي والعلمي والفني (بشقيه الكلاسيكس والحديث) مع العالمين العربي والاسلامي ,وتبعا للنظام الداخلي للمعهد يعمل

المعهد على تحقيق أهدافه من خلال :

         أن يكون متاحا للباحثين والفنانين

        أطلاق المشاريع في حقول الدراسة الملائمة

         التعاون مع معاهد البحث العلمي والبعثات ومجتمع الفنانيين

        الدعم والدعاية للمنشورات

      

ولاحقا لتأسيس المعهد والذي أتى ـ بعد اتصالات على المستوى الحكومي بين الدنمرك وسورياـ كان هناك وعد من مؤسسة ديفد للتمويل لوزارة التعليم الدنمركية بعملية تمويل مستمرة بمبلغ 20 مليون كرون دنمركي لتأسيس وايجاد مكان ملائم للمعهد في الشرق الاوسط وكذلك وعد من مؤسسة أتش بي للباحثين الدانمركيين عن فلسطين لتامين تأسيس المكتبة في المعهد . وكذلك تأمين دعم مالي لخطوات أنشاء المعهد

      

ومع هذه الوعود ووعود اخرى للتمويل من وزارة التعليم , وزارة البحث العلمي, وزارة الثقافة , جامعة كوبنهاجن, أرثوس و أوبنوسو و من المتحف الوطني للفترة التجريبية تم تأمين اتلمويل الضروري لعمل المعهد.

        

أسس المعهد في الدنمرك عام 1998 كمؤسسة مستقلة عندما قررت مجموعة من الوزارات والجامعات دعم المعهد وادارة العمل بشكل جماعي.

         وفي سوريا أسس المعهد بمرسوم رئااسي من الرئيس بشار الأسد في 12 / تشرين الأول عام 2000 وتم الأفتتاح الرسمي للمعهد بعد ذلك بشهر.